Y染色体の変異と2型糖尿病リスクとの関連が示された

　研究グループは、バイオバンク・ジャパン（日本）やUKバイオバンク（英国）などに登録された男性30万人以上のヒトゲノム情報を用い、Y染色体の生殖細胞系列変異であるハプログループと、体細胞変異であるLOYを網羅的に解析した。日本人集団の男性は主にハプログループC（10.3％）、D（34.0％）、O（53.7％）に分類され、このうちDは日本人集団に特有な系統であり、南西諸島の一部地域で高頻度に認められた。LOYについては、日本人集団の約8.0％、英国人集団の約11.7％で確認され、加齢や喫煙との関連が示された。

　疾患との関連解析では、ハプログループDが2型糖尿病の発症リスク低下と関連する一方、LOYは2型糖尿病や気管支喘息など複数の疾患のリスク上昇と関連することが明らかになった。研究グループは日本国内の複数のバイオバンクを統合したゲノムワイド関連解析も実施し、LOYに関連する遺伝的変異を新たに10か所同定した。さらに、東北メディカル・メガバンク計画の独立した集団においても同様の傾向が確認されたと報告している。

　既存の2型糖尿病リスク予測に用いられるポリジェニック・リスク・スコア（PRS）は、主に常染色体の情報に基づいて構築されてきたが、これにY染色体ハプログループおよびLOYの情報を組み合わせたところ、予測精度が向上したことが示された。加えて、シングルセル遺伝子発現解析により、LOYは血液中の単球で高頻度に認められ、転写因子FLI1の活性低下と関連することが示された。膵臓においても、インスリンを分泌するベータ細胞にLOYが多く認められ、遺伝子発現プロファイルの変化が確認されたと報告している。