日本人大腸がんの約半数にコリバクチン関連変異を確認

　研究グループは、国立がん研究センター中央病院と大阪大学医学部附属病院で治療を受けた大腸がん患者200例を対象に、がん細胞のDNA全体を調べる全ゲノム解析を実施した。その結果、対象の約44.8%において、大腸菌が産生する毒素「コリバクチン」によって生じたとみられる特徴的な変異シグネチャー（DNAの傷跡のパターン）が確認された。

　このコリバクチン関連変異は、大腸がんの発生・進展に関わるAPC、BRAF、TP53といったドライバー遺伝子にも見られ、発がん過程に直接関与していることが示された。特にAPC遺伝子は大腸がん発生の最初期に異常が生じるとされる遺伝子で、コリバクチン関連変異シグネチャーを持つ大腸がんでは、この異常が10歳未満という幼少期にすでに生じている可能性も示された。

　年齢別に見ると、40歳未満で発症した若年発症大腸がんでは約70%にコリバクチン関連変異シグネチャーが認められ、年齢が高くなるにつれてこの割合は徐々に低下した。また、この変異シグネチャーは1965年以降に出生した患者で高頻度に確認された。

　さらに研究グループは、腸内細菌叢を網羅的に調べるメタゲノム解析とAI（人工知能）解析を組み合わせ、腸内細菌叢の特徴に基づき大腸がんを4つのサブタイプに分類できることを示した。コリバクチン関連変異シグネチャーを持つ大腸がんは、このうち「サブタイプ3」と呼ばれる群に多く認められ、大腸がんとの関連が知られる細菌Fusobacterium nucleatumが少ない傾向も確認された。